14 декабря 2007 года был сформирован Муниципальный совет Прохоровского района в количестве 36 человек. Муниципальный совет Прохоровского района является постоянно действующим представительным органом муниципального района, обладает правами юридического лица.
Членами Муниципального совета района являются главы поселений, входящие в состав муниципального района, а также депутаты представительных органов указанных поселений, избираемые ими из своего состава по одному депутату от представительного органа каждого поселения в порядке, предусмотренном муниципальными правовыми актами соответствующих поселений. Муниципальный совет района может осуществлять свои полномочия в случае, если он сформирован не менее, чем на две трети от установленной численности его членов.
В исключительной компетенции Муниципального совета района находятся:

• принятие Устава муниципального района и внесение в него изменений и дополнений;
• утверждение бюджета муниципального района и отчета о его исполнении;
• установление, изменение и отмена местных налогов и сборов в соответствии с законодательством Российской Федерации о налогах и сборах;
• принятие планов и программ развития муниципального района, утверждение отчетов об их исполнении;
• определение порядка управления и распоряжения имуществом, находящимся в муниципальной собственности;
• определение порядка принятия решений о создании, реорганизации и ликвидации муниципальных предприятий и учреждений, а также об установлении тарифов на услуги муниципальных предприятий и учреждений;
• определение порядка участия муниципального района в организациях межмуниципального сотрудничества;
• определение порядка материально-технического и организационного обеспечения деятельности органов местного самоуправления;
• контроль за исполнением органами местного самоуправления и должностными лицами местного самоуправления полномочий по решению вопросов местного значения

Иные полномочия Муниципального совета района определяются федеральными законами и принимаемыми в соответствии с ними Уставом и законами Белгородской области, а также Уставом муниципального района «Прохоровский район» Белгородской области.

На первом заседании Муниципального совета Прохоровского района, состоявшемся 14 декабря 2007 года, его председателем единогласно был избран Дедов Василий Яковлевич, депутат Земского собрания Призначенского сельского поселения.
Заместителем председателя Муниципального совета района избран Давыдов Виктор Иванович, депутат Земского собрания Беленихинского сельского поселения.

В соответствии с Регламентом Муниципального совета Прохоровского района первого созыва, утвержденного решением Муниципального совета района от 14 декабря 2007 года № 6, и Положениями о постоянных комиссиях Муниципального совета Прохоровского района первого созыва, утверждённых решениями Муниципального совета района от 14 декабря 2007 года № 1,7,8, 9, в Муниципальном совете Прохоровского района образованы четыре постоянных комиссии:

• постоянная мандатная комиссия, председатель комиссии – Чернов Анатолий Алексеевич;
• постоянная комиссию по экономическому развитию,  бюджету, финансам и налоговой политике, председатель комиссии – Давыдов Виктор Иванович;
• постоянная комиссия по социально- культурному развитию, делам ветеранов и молодёжи, председатель комиссии – Сошенко Светлана Викторовна;
• постоянная комиссия по развитию хозяйственного комплекса, земельным вопросам и экологии,   председатель комиссии – Беседин Юрий Петрович.

В соответствии со статьей 2 Регламента Муниципального совета Прохоровского района и на основании уведомления о создании фракции Всероссийской политической партии «Единая Россия», Муниципальный совет Прохоровского района зарегистрировал в Муниципальном совете района фракцию Всероссийской политической партии «Единая Россия» (решение от 23 апреля 2008 года № 29)
На сегодняшний день во фракции Всероссийской политической партии «Единая Россия» Муниципального совета района состоит 36 человек, председатель фракции - Давыдов Виктор Иванович.